按照《上海市科学技术奖励规定》，经过网络评审、专家初评、专家复核、上海市科学技术奖励委员会审定，2016年度上海市科学技术奖共授奖265项（人），其中授予10人青年科技杰出贡献奖，22项成果自然科学奖，30项成果技术发明奖，201项成果科技进步奖和2项国际科技合作奖。自2012年首次设立科技奖励特等奖奖项至今，上海市共授出5个特等奖，上海光机所是第2个获得技术发明奖特等奖的单位。